Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ddx60E9PZQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ddx60E9PZQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddx60E9PZQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ddx60E9PZQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx60E9PZQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms