Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd2E9PZM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chd2E9PZM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Chd2E9PZM4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chd2E9PZM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd2E9PZM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd2E9PZM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Chd2E9PZM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd2E9PZM4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238 ms