Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gcom1E9PZ54 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcom1E9PZ54 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcom1E9PZ54 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms