Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30bE9PVL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30bE9PVL6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim30bE9PVL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim30bE9PVL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30bE9PVL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms