Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa28D3Z1V9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa28D3Z1V9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa28D3Z1V9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa28D3Z1V9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa28D3Z1V9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa28D3Z1V9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa28D3Z1V9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms