Protein–RNA interactions for Protein: D3YZG8

Mthfd2l, Probable bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd2lD3YZG8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2lD3YZG8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mthfd2lD3YZG8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mthfd2lD3YZG8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mthfd2lD3YZG8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mthfd2lD3YZG8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms