Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7257D3YX25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7257D3YX25 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7257D3YX25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7257D3YX25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm7257D3YX25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm7257D3YX25 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm7257D3YX25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm7257D3YX25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms