Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms