Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsperg2C6KI89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsperg2C6KI89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Catsperg2C6KI89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Catsperg2C6KI89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Catsperg2C6KI89 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms