Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17333C6EQI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm17333C6EQI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17333C6EQI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms