Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptprz1B9EKR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptprz1B9EKR1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptprz1B9EKR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms