Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nxpe3B9EKK6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nxpe3B9EKK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nxpe3B9EKK6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nxpe3B9EKK6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxpe3B9EKK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nxpe3B9EKK6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms