Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol6B7ZC55 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol6B7ZC55 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol6B7ZC55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol6B7ZC55 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apol6B7ZC55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol6B7ZC55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms