Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syce3B5KM66 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syce3B5KM66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce3B5KM66 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syce3B5KM66 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce3B5KM66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms