Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B4DXG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B4DXG7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4DXG7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4DXG7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
B4DXG7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DXG7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DXG7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DXG7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B4DXG7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B4DXG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B4DXG7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B4DXG7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DXG7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DXG7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B4DXG7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
B4DXG7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
B4DXG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B4DXG7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B4DXG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B4DXG7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DXG7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DXG7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DXG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B4DXG7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DXG7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DXG7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DXG7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DXG7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B4DXG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DXG7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B4DXG7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DXG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DXG7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B4DXG7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DXG7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DXG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B4DXG7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms