Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clrn2B2RVW2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Clrn2B2RVW2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Clrn2B2RVW2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clrn2B2RVW2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clrn2B2RVW2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms