Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf1B2RRD7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Brpf1B2RRD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Brpf1B2RRD7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brpf1B2RRD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brpf1B2RRD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Brpf1B2RRD7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms