Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap42B2RQE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgap42B2RQE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap42B2RQE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap42B2RQE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap42B2RQE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap42B2RQE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms