Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NhsB1AV60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NhsB1AV60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NhsB1AV60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NhsB1AV60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NhsB1AV60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NhsB1AV60 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NhsB1AV60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NhsB1AV60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms