Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprsB0V2N1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprsB0V2N1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprsB0V2N1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms