Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem238A9JSM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem238A9JSM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem238A9JSM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem238A9JSM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms