Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE1LA8MT33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE1LA8MT33 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE1LA8MT33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCE1LA8MT33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms