Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SFI1A8K8P3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SFI1A8K8P3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SFI1A8K8P3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFI1A8K8P3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SFI1A8K8P3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFI1A8K8P3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SFI1A8K8P3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFI1A8K8P3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms