Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRIQ3A6PVS8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ3A6PVS8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRIQ3A6PVS8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ3A6PVS8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms