Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85CA6NKD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC85CA6NKD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85CA6NKD9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC85CA6NKD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC85CA6NKD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms