Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NIZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NIZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A6NIZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NIZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NIZ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NIZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NIZ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NIZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NIZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NIZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NIZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NIZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NIZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NIZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NIZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NIZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NIZ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NIZ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NIZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NIZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NIZ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NIZ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NIZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NIZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NIZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NIZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NIZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NIZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NIZ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NIZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NIZ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NIZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A6NIZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NIZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NIZ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NIZ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NIZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NIZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NIZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NIZ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NIZ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NIZ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NIZ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NIZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NIZ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NIZ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NIZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NIZ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NIZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NIZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NIZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NIZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NIZ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A6NIZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NIZ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NIZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NIZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A6NIZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A6NIZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A6NIZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NIZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NIZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NIZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NIZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NIZ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NIZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NIZ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms