Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms