Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL33A6NCF5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL33A6NCF5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL33A6NCF5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL33A6NCF5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL33A6NCF5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms