Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC13A5PLN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC13A5PLN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC13A5PLN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC13A5PLN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms