Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS37CA5D8V6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VPS37CA5D8V6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS37CA5D8V6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS37CA5D8V6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms