Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plcb2A3KGF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plcb2A3KGF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plcb2A3KGF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Plcb2A3KGF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms