Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp8b5A3FIN4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp8b5A3FIN4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp8b5A3FIN4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp8b5A3FIN4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp8b5A3FIN4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8b5A3FIN4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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