Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fbxl16A2RT62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fbxl16A2RT62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbxl16A2RT62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fbxl16A2RT62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbxl16A2RT62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fbxl16A2RT62 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms