Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc43a3A2AVZ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc43a3A2AVZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc43a3A2AVZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a3A2AVZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a3A2AVZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a3A2AVZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms