Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn3aA2ASI5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn3aA2ASI5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scn3aA2ASI5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn3aA2ASI5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scn3aA2ASI5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn3aA2ASI5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn3aA2ASI5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms