Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga8A2ARA8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga8A2ARA8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga8A2ARA8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga8A2ARA8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga8A2ARA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga8A2ARA8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms