Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FocadA2AKG8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FocadA2AKG8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FocadA2AKG8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FocadA2AKG8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FocadA2AKG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FocadA2AKG8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms