Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3pxd2bA2AAY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3pxd2bA2AAY5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3pxd2bA2AAY5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2bA2AAY5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3pxd2bA2AAY5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2bA2AAY5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms