Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm884A2A9H6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm884A2A9H6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm884A2A9H6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm884A2A9H6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm884A2A9H6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms