Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Itgb4A2A863 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itgb4A2A863 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb4A2A863 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Itgb4A2A863 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb4A2A863 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Itgb4A2A863 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb4A2A863 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms