Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm2A2A7B5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Prdm2A2A7B5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prdm2A2A7B5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prdm2A2A7B5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm2A2A7B5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prdm2A2A7B5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prdm2A2A7B5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms