Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdr2lA2A6T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdr2lA2A6T1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdr2lA2A6T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdr2lA2A6T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms