Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCE3A1L190 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCE3A1L190 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYCE3A1L190 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCE3A1L190 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCE3A1L190 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCE3A1L190 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms