Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM223A0PJW6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM223A0PJW6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM223A0PJW6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM223A0PJW6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms