Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trav12-2A0N8N6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trav12-2A0N8N6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trav12-2A0N8N6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trav12-2A0N8N6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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