Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POTEB3A0JP26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POTEB3A0JP26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POTEB3A0JP26 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEB3A0JP26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POTEB3A0JP26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms