Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930469K13RikA0A286YDB2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930469K13RikA0A286YDB2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms