Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J2E0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J2E0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J2E0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J2E0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0B4J2E0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0B4J2E0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0B4J2E0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
A0A0B4J2E0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0B4J2E0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms