Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Trbv2A0A0B4J1G8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbv2A0A0B4J1G8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv2A0A0B4J1G8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv2A0A0B4J1G8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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