Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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